Universitas Katolik Widya Mandala Madiun bermula dengan Gereja Katolik Keuskupan Surabaya mendirikan Yayasan Widya Mandala pada tanggal 7 Juli 1958 yang disahkan dengan Akte Notaris Anwar Mahajudin No. 42/1960 pada tanggal 11 Agustus 1960, dan mendelegasikan kepada Yayasan tersebut hak milik atas tanah, gedung, perabot, perlengkapan, maupun segala sarana dan pra-sarana, yang ada di Madiun Jalan Manggis no.15–17, dan di Surabaya Jalan Dinoyo no.42, dan sekitarnya, yang semuanya milik Gereja Katolik Keuskupan Surabaya, dan mendelegasikan kepada Yayasan tersebut hak dan wewenang untuk dengan itu mendirikan, menyelenggarakan, mengurus dan mengembangkan Perguruan Tinggi :

1. 1. 1. 1. 1. 1. 4 Januari 1960 Yayasan Widya Mandala mendirikan Universitas Katolik Widya Mandala Surabaya, dengan Surat Keputusan Yayasan Widya Mandala Nomor 001/J/Sek/1960.
               2. 20 September 1960 : FKIP Jurusan Bimbingan dan Penyuluhan, dan Jurusan Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia, di Madiun.
               3. 1 September 1961 :  Jurusan Ilmu Alam di Surabaya.
               4. 1 September 1962 : Jurusan Bahasa dan Sastra Inggris di Surabaya.
               5. Kemudian Fakultas Farmasi, Lembaga Pendidikan Ajun Akuntansi, Lembaga Pendidikan Teknik Radio dan Televisi, di Surabaya.
               6. 7 Agustus 1965 : Yayasan Widya Mandala menjadikannya 2 Perguruan Tinggi, yaitu IKIP Widya Mandala dan Universitas Katolik Widya Mandala.
               7. 27 Agustus 1969 : IKIP Widya Mandala disatukan ke dalam Universitas Katolik Widya Mandala, sebagai Fakultas Ilmu Pendidikan Jurusan Bimbingan dan Penyuluhan, dan Fakultas Ilmu Keguruan.
               8. Pada 18 Pebruari 1985 : Berdasarkan Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan (SK Mendikbud no. 070/Q/1985, no. 071/Q/1985, dan no. 072/Q/1985), unit dari Universitas “Widya Mandala” yang ada di Madiun menjadi Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan (STKIP) Katolik “Widya Mandala” di Madiun, dan, juga berdasarkan surat Badan Pengurus lengkap Yayasan “Widya Mandala” di Surabaya sebagaimana dicatat dalam Akte Notaris Elly Nangoy S.H. (no. 25, tanggal 26 Mei 1986), secara resmi dipisah dari Universitas Katolik “Widya Mandala” di Surabaya.

STKIP  tersebut terdiri atas :

- Jurusan Ilmu Pendidikan Program Studi Psikologi Pendidikan dan Bimbingan,

- Jurusan Pendidikan Bahasa dan Seni

* Program Studi Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia

* Program Studi Pendidikan dan Sastra Inggris.

- Jurusan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam.

Pada 26 Mei 1986 didirikan Yayasan baru yang bernama Yayasan Widya Mandala Madiun dengan Akte Notaris Elly Nangoy S.H. no.2. Lalu dilimpahkanlah oleh Gereja Katolik Keuskupan Surabaya kepada Yayasan Widya Mandala Madiun pendelegasian hak milik atas semua asset yang ada di Madiun, baik tanah, gedung, perabot, perlengkapan, maupun segala sarana dan pra-sarana, baik yang lama maupun yang baru, dan pendelegasian hak dan wewenang untuk, dengan itu, menyelenggarakan, mengurus dan mengembangkan lebih lanjut STKIP tersebut.

Pada tanggal 31 Desember 1991 dengan SK Mendikbud R.I. No. 0687/Q/1991 maka dari STKIP, STBA dan ST-MIPA tersebut didirikanlah satu Universitas Katolik Widya Mandala Madiun.